苹果树秋季修剪是在新梢停止生长以后到进入相对休眠期以前(8~9 月份进行效果好）进行。此时树体开始贮藏营养，适度进行修剪，可起到控制树势和枝条旺长，紧凑树体，改善光照，充实枝、芽，复壮内膛等作用。秋季修剪抑制旺长的作用较夏季修剪要弱，但比冬季修剪要强，剪后所留的伤口，削弱树势的反应也要比冬剪弱，有利抑制徒长。但秋季修剪的修剪量要轻，不宜大杀、大砍。一般秋季修剪多在幼树、旺树上进行，尤其对控制密植园、郁闭园的树冠交接效果最好；秋季修剪对不结果树或结果少的枝条，特别对乔化红富士品种的效果明显。秋季修剪主要采取拿枝、疏枝、摘心、疏梢和拉枝等手段。
拿枝主要是对当年抽生的直立新梢软化处理使其成为水平状。疏枝主要是疏去密生枝、竞争枝、直立枝及重叠枝等，以改善光照条件。 9月上、中旬，对所有营养枝通过摘心剪去秋梢的幼嫩部分，可减少消耗，增加贮藏；但摘心不能过早，否则会抽生副梢；操作时通常只摘去梢端 3-5cm 长度，最多不应超过 15 cm。 疏梢特别是疏大枝，数量不宜过多，以改善冠内光照为掌握的基本尺度。拉枝应根据树形结构要求，拉开枝条角度，适时调整方位，使其分布均匀并充分占据空间。纺锤形的主枝角度应接近 90° ,辅养枝的角度应超过 90° ' 同时应彻底疏除中心干、主枝上无用的直立背上新枝和大枝分叉处、梢头及剪锯口附近的萌生枝，以实现疏密增光，保中干强枝；对过密的两三年生枝条或中小型结果枝组，可适当疏除，使枝条或结果枝组在母枝上的间隔保持在 20cm 左右；辅养枝拉枝应尽量拉平拉展。
冬季修剪自秋季自然落叶后到来春萌芽前进行， 冬季修剪时果树处在休眠期，剪枝一般损失营养最少，但在冬季＂抽条“严重地区，不宜冬剪。冬季修剪主要是合理调整树体结构，平衡树势，调节从属关系，包括骨干枝数量的控制，枝组比例与大小、总枝蜇与花芽数量、生长枝与结果枝比例、树冠大小和辅养枝疏密程度的调整控制等。 而生长季修剪则主要是通过疏、缓、拉、扭、伤、变等措施，均衡树势、枝势，提高有效枝的数址，加速结果枝组的培养。冬季修剪全年修剪量幼树应为总枝量的 10%-20%,盛果期树应为总枝扯的 30%。修剪后幼树缓放枝与短截枝的比例为 10: 1(适宜重剪的品种为 10: 2); 结果树缓放枝与短截枝的比例为 10: 3, 最多不超过 10: 2。
