近年来，我省将种苗产业作为实施千亿级果业产业的重要抓手，多措并举，在果树育种上加大投入，选育出了一大批自主品牌的新优品种，如秦脆苹果、秦蜜苹果、瑞阳苹果、瑞雪苹果、金艳猕猴桃、华优猕猴桃等。实施育繁推一体化种苗繁育工程，在苹果、猕猴桃基地县新建一批育苗基地，年产能达到5000万株，确保新建园布局新优品种、改造园优质接穗，支撑果业品种升级换代。据统计，截至2018年年底，全省共有果树苗木生产基地近3万亩，各类果树苗木总量1.2亿株；2019年，可出圃苗木6000余万株，其中，苹果苗4500万株。千阳、白水、临渭、扶风及杨凌一带是我省果树苗木的集中产区。
随着大量社会资本介入，我省苗木繁育不断向企业化、专业化、规模化、标准化发展，形成了个体、合作社、企业共存的局面。压条繁育、嫩枝扦插、组织培养等育苗技术已在全省广泛应用。至2018年年底，我省在册登记的果树育苗企业有80余个，其中苗木基地面积1000亩以上的企业5个，500亩以上的企业8个，11家开展种苗组培快繁生产，22家采购了起苗机械并建成贮存冷库。陕西海棠生态农林有限公司在组培育苗上走在全国前列。陕西的各类苗木，尤其是脱毒苗、矮化苗、带分枝苗畅销全国果区。
