本次普查共发现可对林木、种苗等林业植物及其产品造成危害的林业有害生物种类6179种，其中昆虫类5030种，真菌类726种，细菌类21种，病毒类18种，线虫类6种，植原体类11种，鼠（兔）类52种，螨类76种，植物类239种。
此次普查发现，在我国发生的外来林业有害生物有45种，与2006年的结果相比多出13种，包括刺槐突瓣细蛾、悬铃木方翅网蝽、松树蜂、扶桑绵粉蚧等。发生面积超过100万亩的林业有害生物种类有58种，包括椰心叶甲、紫茎泽兰、日本松干蚧等。
本次普查涉及的外来林业有害生物种类（45种）和发生面积超过100万亩的林业有害生物种类（58种）共99种（有4种重复），通过构建林业有害生物危害性评价体系，将其划分为4个等级。
其中，一级危害性林业有害生物只有1种，为松材线虫；二级危害性生物共31种，包括美国白蛾、光肩星天牛、薇甘菊等；三级危害性生物共37种，包括多斑白条天牛、舞毒蛾、落叶松毛虫等；四级危害性生物共30种，包括日本鞘瘿蚊、飞机草、大米草等。
