苗木产业是水发神农集团的发展难点。按照水发集团加快转型发展、提升质效、扭亏增盈有关要求，水发神农主动作为，积极拓展参与国家储备林项目、农田林网和林粮间作项目、乡村振兴环境整治项目，与山东、河南、安徽等地县乡（镇）政府及村集体合作林木种植，盘活转移苗木资产。通过利益共享的多赢模式，将“四旁”（水旁、路旁、村旁、宅旁）闲置地块盘活,在降低企业地租成本、推动资产保值增值的同时，发展壮大乡村产业，拓宽农民增收渠道，打造乡村振兴绿色“聚宝盆”。
水发神农与河南温县政府部门达成合作，由温县投资集团代表政府出资的PPP模式项目，可以提供约1.6万亩造林用地。在与合作方完成土地流转、苗木移栽并达到约定成活率后，由所属政府、村集体、种植大户、村民和苗木管理人员共同承担苗木的养护管理。水发神农推进在苏北、皖北、豫东、山东、河北等地土地流转项目和基本农田提升改造项目，在农田路网、水网两侧规划建设农田林网，选择合适地块进行林粮间作，神农集团提供苗木和管护，土地流转合作方提供土地。积极对接地方政府参与乡村振兴环境整治，充分利用国有林场、集体林场、河道护堤、房前屋后、道路两侧等乡村闲置土地资源，水发神农集团提供苗木和管护，地方政府、村集体提供土地。
据统计，目前全国绿化苗木存量不足2020年初的40%。水发神农通过苗木资产转移以保存足量苗木，转移树种以楸树、国槐、白蜡、法桐、丝绵木、海棠、苦楝、五角枫等为主。随着苗木管护负责人制度的落实，既减少苗木管理人员数量，还提高了苗木管理人员积极性。将现有种植在耕地上的苗木转移至可造林地块，避免苗木资产因政策风险导致的损失。苗木转移后获得较大的行间距，更加充足的光照和水分可以大幅减少苗木养护物力成本，极大地降低苗木病虫害发生几率。这种合作模式进一步提高农民收入，助力乡村振兴，推动美丽乡村建设，体现了国有企业的职责和担当。
